育成ドラフトでは12球団が計57人を指名した。指名選手は次の通り。（丸数字は指名順）
▽日本ハム （1）藤田大清外野手（埼玉・花咲徳栄高）（2）中山晶量投手（四国アイランドリーグplus・徳島）（3）山口アタル外野手（米テキサス大タイラー校）（4）山本晃大投手（BCリーグ・信濃）
▽中日 （1）松山晋也投手（八戸学院大）（2）野中天翔投手（秋田・明桜高）（3）樋口正修内野手（BCリーグ・埼玉）
▽ロッテ （1）吉川悠斗投手（埼玉・浦和麗明高）（2）白浜快起投手（福岡・飯塚高）（3）勝又琉偉内野手（静岡・富士宮東高）（4）黒川凱星内野手（福島・学法石川高）
▽広島 （1）名原典彦外野手（青森大）（2）中村貴浩外野手（九産大）（3）辻大雅投手（東京・二松学舎大付高）
▽楽天 （1）辰見鴻之介内野手（西南学院大）（2）古賀康誠投手（山口・下関国際高）（3）竹下瑛広投手（函館大）（4）永田颯太郎内野手（国立台湾体育運動大）
▽巨人 （1）松井颯投手（明星大）（2）田村朋輝投手（山形・酒田南高）（3）吉村優聖歩投手（高知・明徳義塾高）（4）中田歩夢内野手（青森・東奥義塾高）（5）相沢白虎内野手（神奈川・桐蔭学園高）（6）三塚琉生外野手（群馬・桐生第一高）（7）大城元外野手（沖縄・未来沖縄高）（8）北村流音投手（群馬・桐生第一高）（9）森本哲星投手（千葉・市船橋高）
▽西武 （1）野村和輝投手（日本海オセアンリーグ・石川）（2）日隈モンテル外野手（四国アイランドリーグplus・徳島）（3）三浦大輝投手（中京大）（4）是沢涼輔捕手（法大）
▽阪神 （1）野口恭佑外野手（九産大）
▽ソフトバンク （1）赤羽蓮投手（茨城・霞ケ浦高）（2）山下恭吾内野手（福岡大大濠高）（3）木村光投手（仏教大）（4）内野海斗投手（広島・武田高）（5）岡植純平投手（兵庫・飾磨工高）（6）佐々木明都投手（学法福島高）（7）水口創太投手（京大）（8）宮崎颯投手（東農大）（9）重松凱人外野手（亜大）（10）前田純投手（日本文理大）（11）佐藤航太内野手（青森・八戸学院光星高）（12）飛田悠成内野手（神奈川・金沢高）（13）西尾歩真内野手（中京学院大）（14）盛島稜大捕手（沖縄・興南高）
▽DeNA （1）上甲凌大捕手（四国アイランドリーグplus・愛媛）（2）鈴木蓮内野手（滋賀学園高）（3）今野瑠斗投手（長野・東京都市大塩尻高）（4）渡辺明貴投手（BCリーグ・茨城）（5）草野陽斗投手（福島・東日本国際大昌平高）
▽オリックス （1）西浜勇星投手（BCリーグ・群馬）（2）才木海翔投手（大経大）（3）入山海斗投手（東北福祉大）（4）茶野篤政外野手（四国アイランドリーグplus・徳島）（5）村上喬一朗捕手（法大）
▽ヤクルト （1）橋本星哉捕手（中央学院大）
